洞中有较多巨型块石及砂砾。巨型块石,是洞中顶棚巨石,在重力作用下,崩塌下来的。砂砾是地下河长期对洞中石块侵蚀、冲刷、搬运、堆积而成。垂直方向的地壳运动可以使地壳抬升,使地下水位下降。阴河洞就是在地壳抬升中形成的最下层水洞。